菌落PCR出現(xiàn)假陽性的原因:可能使用了錯誤的PCR鑒定引物、樣品間交叉污染、PCR試劑的污染、PCR擴增產物的污染、氣溶膠污染以及實驗室中克隆質粒的污染。?
?1.使用了錯誤的PCR鑒定引物?:
在進行菌液PCR時,如果使用了基因特異引物,可能會從游離的目的片段DNA上擴增出條帶,而不是從重組質粒上,導致假陽性結果。推薦使用一對載體通用引物進行菌液PCR鑒定,以減少假陽性的發(fā)生?。
2. ?樣品間交叉污染?:
樣品污染可能由于收集樣本的容器被污染、樣本放置時密封不嚴溢于容器外、容器外粘有樣本而造成相互間交叉污染。此外,樣本核酸模板在提取過程中,由于吸樣槍污染也可能導致標本間污染?。
?3.PCR試劑的污染?:
在PCR試劑配制過程中,加樣槍、容器、雙蒸水及其它溶液被PCR核酸模板污染,也是造成假陽性的原因之一?。
?4.PCR擴增產物的污染?:
PCR反應中最主要最常見的污染問題是PCR擴增產物污染。極微量的PCR產物污染就可形成假陽性?。
?5.氣溶膠污染?:
在空氣與液體面摩擦時可形成氣溶膠,劇烈地搖動反應管、開蓋時、吸樣時及污染進樣槍的反復吸樣都可形成氣溶膠而污染。一個氣溶膠顆??珊?8000拷貝,因而由其造成的污染是一個值得特別重視的問題?。
?6.實驗室中克隆質粒的污染?:
由于克隆質粒在單位容積內含量相當高,且在純化過程中需用較多的用具及試劑,活細胞內的質粒具有很強的生命力,其污染可能性也很大,這也是造成假陽性的一個重要原因?。
為了避免假陽性的出現(xiàn),應采取適當?shù)拇胧p少上述各種污染的可能性,如使用正確的PCR鑒定引物、嚴格操作規(guī)范、避免交叉污染等?。