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瓊脂糖凝膠電泳制備方法及核酸檢測
點擊次數(shù):289 更新時間:2023-01-06

一. 實驗目的


1、掌握瓊脂糖凝膠電泳的原理;


2、學習瓊脂糖凝膠電泳的操作。


二. 實驗原理


瓊脂糖是一種天然聚合長鏈狀分子,沸水中溶解,45℃開始形成多孔性剛性濾孔,凝膠孔徑的大小決定于瓊脂糖的濃度。


DNA分子在堿性環(huán)境中帶負電荷,在外加電場作用下向正極泳動。DNA分子在瓊脂糖凝膠中泳動時,有電荷效應與分子篩效應。不同DNA,其分子量大小及構(gòu)型不同,電泳時的泳動率就不同,從而分出不同的區(qū)帶。瓊脂糖凝膠電泳法分離DNA,主要是利用分子篩效應,遷移速度與分子量的對數(shù)值成反比關系。


溴化乙錠(EB)未扁平狀分子,在紫外照射下發(fā)射熒光。EB可與DNA分子形成EB-DNA復合物,其發(fā)射的熒光強度較游離狀態(tài)EB發(fā)射的熒光強度大10倍以上,且熒光強度與DNA含量成正比。


三、儀器和試劑


儀器: 微量移液器,電泳儀,電泳槽,微波爐


試劑: 瓊脂糖:1.0%;電泳緩沖液(50 × TAE 電泳緩沖液取Tris24.2g ,冰醋酸5.7ml , 0.25mol/L EDTA (pH8.0)20ml ,加蒸餾水至100ml ) EB:5 ?l / 100 ml TBE


電泳材料:標準分子量核酸(DL2000)


四. 操作步驟


(1)制膠(以20 mL為例)


a. 稱取0.2 g 瓊脂糖,加入20 ml 的1XTAE緩沖液(pH 8.0),搖勻;


b. 微波爐加熱,至瓊脂糖wan全溶解(要防止過熱溢出三角瓶);


c.將制膠板放入制膠槽中,插入適當?shù)氖嶙樱瑢⑷芙獾沫傊牵s50℃)加入2ul EB后,混均勻,倒入其中,直至厚度為4~6 mm(如有氣泡要把氣泡趕出),在室溫下冷卻凝固(約30~ 45 min);


d.小心垂直向上拔出梳子,以保證點樣孔完好,將膠板置于電泳槽中。


(2)點樣


用微量移液器將5 ?l含藍色染液的 DL2000 加入點樣孔下部。


(3)電泳


打開電源開關,調(diào)節(jié)電壓至3~5 V/cm(約100 V),可見到溴酚藍條帶由負極向正極移動,約30-40分鐘后即可觀察結(jié)果。


(4)觀察


將電泳好的膠置于紫外透射檢測儀上,打開紫外燈,可見到橙紅色核酸條帶,根據(jù)條帶粗細,可粗略估計該樣品DNA的濃度。如同時有已知分子量的標準DNA進行電泳,則可通過線性DNA條帶的相對位置初步估計樣品的分子量。


五、實驗結(jié)果


點樣時效果較好的照片點出的白色熒光線比較亮,條帶粗細均勻;條帶沒有出現(xiàn)兩端粗中間細的情況


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