一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康?/span>
1. 了解凝膠層析的原理及其應(yīng)用。
2. 通過測(cè)定蛋白質(zhì)分子量的訓(xùn)練,初步掌握凝膠層析技術(shù)。
二、實(shí)驗(yàn)原理
凝膠層析又稱排阻層析,凝膠過濾,滲透層析或分子篩層析等。它廣泛地應(yīng)用于分離、提純、濃縮生物大分子及脫鹽、去熱源等,而測(cè)定蛋白質(zhì)的分子量也是它的重要應(yīng)用之一。凝膠是一種具有立體網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)且呈多孔的不溶性珠狀顆粒物質(zhì)。用它來分離物質(zhì),主要是根據(jù)多孔凝膠對(duì)不同半徑的蛋白質(zhì)分子(近于球形)具有不同的排阻效應(yīng)實(shí)現(xiàn)的。亦即它是根據(jù)分子大小這一物理性質(zhì)進(jìn)行分離純化的。對(duì)于某種型號(hào)的凝膠,一些大分子不能進(jìn)入凝膠顆粒內(nèi)部而wan全被排阻在外,只能沿著顆粒間的縫隙流出柱外;而一些小分子不被排阻,可自由擴(kuò)散,滲透進(jìn)入凝膠內(nèi)部的篩孔,爾后又被流出的洗脫液帶走。分子越小,進(jìn)入凝膠內(nèi)部越深,所走的路程越多,故小分子最后流出柱外,而大分子先從柱中流出。一些中等大小的分子介于大分子與小分子之間,只能進(jìn)入一部分凝膠較大的孔隙,亦即部分排阻,因此這些分子從柱中流出的順序也介于大、小分子之間。這樣樣品經(jīng)過凝膠層析后,分子便按照從大到小的順序依次流出,達(dá)到分離的目的。
對(duì)于任何一種被分離的化合物在凝膠層析柱中被排阻的范圍均在0~100%之間,其被排阻的程度可以用有效分配系數(shù) Kav(分離化合物在內(nèi)水和外水體積中的比例關(guān)系)表示,Kav值的大小和凝膠柱床的總體積(Vt)、外水體積(V0)以及分離物本身的洗脫體積(Ve)有關(guān):
Kav = (Ve-V0)/(Vt-V0) ----------- (1)
在限定的層析條件下,Vt和V0都是恒定值,而Ve是隨著分離物分子量的變化而改變。分子量大,Ve值小,Kav值也小。反之,分子量小Ve值大,Kav值大。
有效分配系數(shù)Kav是判斷分離效果的一個(gè)重要參數(shù),同時(shí)也是測(cè)定蛋白質(zhì)分子量的一個(gè)依據(jù)。在相同層析條件下,被分離物質(zhì) Kav值差異越大,分離效果越好。反之,分離效果差或根本不能分開。在實(shí)際的實(shí)驗(yàn)中,我們可以實(shí)測(cè)出Vt、V0及Ve的值,從而計(jì)算出Kav的大小。對(duì)于某一特定型號(hào)的凝膠,在一定的分子量范圍內(nèi),Kav與logMw (Mw表示物質(zhì)的分子量) 成線性關(guān)系:
Kav =-b logMw + C --------- (2)
其中 b,C為常數(shù)。
同樣可以得到:
Ve =-b’logMw + C’ --------- (3)
其中 b’, C’為常數(shù)。即 Ve 與 logMw 也成線性關(guān)系。我們可以通過在一凝膠柱上分離多種已知分子量的蛋白質(zhì)后,并根據(jù)上述的線性關(guān)系繪出標(biāo)準(zhǔn)曲線,然后用同一凝膠柱測(cè)出其它未知蛋白的分子量。
三、器材與試劑
(一)器材
1. 玻璃層析柱((20mm×60cm)
2. 恒流泵(或下口恒壓貯液瓶)
3. 自動(dòng)部分收集器
4. 紫外分光光度計(jì)
5. 100ml試劑瓶
6. 1000ml量筒
7. 250ml燒杯
8. 50ml、 100ml燒杯
9. 10ml(或5ml)刻度試管
(二)試劑
1. 標(biāo)準(zhǔn)蛋白
(1)牛血清白蛋白:Mw=67,000(上海生化所)
(2)雞卵清清蛋白:Mw=45,000(美國SIGMA公司)
(3)胰凝ru蛋白酶原 A:Mw=24,000(美國SIGMA公司)
(4)溶jun酶:Mw =14,300
2. 未知蛋白質(zhì)樣品:由實(shí)驗(yàn)室準(zhǔn)備
3. 0.025M KCl-0.1M HAC(乙酸)(洗脫液1000ml)
四、實(shí)驗(yàn)操作
(一)凝膠的溶脹
稱取7g Sephadex G- 75 于 250ml 燒杯中加入洗脫液100ml,置室溫溶脹2~3天,反復(fù)傾瀉去掉細(xì)顆粒,然后減壓抽氣去除凝膠孔隙中的空氣,沸水浴中煮沸2~3小時(shí)(可去除顆粒內(nèi)部的空氣及滅菌)。
(二)裝柱
1. 取潔凈的的玻璃層析柱垂直固定在鐵架臺(tái)上。
2. 凝膠柱總體積(Vt)的測(cè)定:
在距柱上端約 5cm 處作一記號(hào),關(guān)閉柱出水口,加入去離子水,打開出水口,液面降至柱記號(hào)處即關(guān)閉出水口,然后用量筒接收柱中去離子水(水面降至層析柱玻璃篩板),讀出的體積即為柱床總體積Vt。也可以最后走完未知蛋白后再測(cè)定Vt。
3. 在柱中注入洗脫液(約1/3柱床高度),將凝膠濃漿液緩慢傾入柱中,待凝膠沉積約1cm ~ 2cm 高度后打開出水口,流速一般用 3ml~6ml / 10 min。膠面上升到柱記號(hào)處則裝柱完畢,注意裝柱過程中凝膠不能分層。然后關(guān)閉出水口,靜置片刻,等凝膠wan全沉降,則接上恒流泵,用1~2倍床體積的洗脫液平衡柱子,使柱床穩(wěn)定。
(三)V0的測(cè)定
吸去柱上端的洗脫液(切不要攪亂膠面,可復(fù)蓋一張濾紙或尼龍網(wǎng))。打開出水口,使殘余液體降至與膠面相切(但不要干膠),關(guān)閉出水口。用細(xì)滴管吸取0.5 ml(2mg/ml)藍(lán)色葡聚糖— 2000,小心地繞柱壁一圈(距膠面2mm)緩慢加入,然后迅速移至柱中央慢慢加入柱中,打開出水口(開始收集?。?,等溶液滲入膠床后,關(guān)閉出水口,用少許洗脫液加入柱中,滲入膠床后,柱上端再用洗脫液充滿后用3ml/10分鐘的的速度開始洗脫。最后作出洗脫曲線。收集并量出從加樣開始至洗脫液中藍(lán)色葡聚糖濃度最高點(diǎn)的洗脫液體積即為V0。注意:藍(lán)色葡聚糖洗下來之后,還要用洗脫液(1~2倍床體積)繼續(xù)平衡一段時(shí)間,以備下步實(shí)驗(yàn)使用。
(四)標(biāo)準(zhǔn)曲線的制作
1. 用洗脫液配制標(biāo)準(zhǔn)蛋白溶液全班共用,溶液中四種蛋白的濃度各為:牛血清清蛋白(2.5mg/ml)、雞卵清清蛋白(6.0mg/ml)、yi凝乳蛋白酶原A(2.5mg/ml)和溶jun酶(2.5mg/ml)。
2. 按(三)的操作方法加入上述標(biāo)準(zhǔn)蛋白溶液(0.5ml~1 ml),以1.5ml/管/5分鐘的速度洗脫并收集洗脫液。
3. 用紫外分光光度計(jì)逐管測(cè)定 A280,并確定各種蛋白的洗脫峰最高點(diǎn),然后量出各種蛋白的洗脫體積 Ve。由于每管只收集了1.5ml洗脫液,量比較少,因此比色時(shí)要加入一定量的洗脫液進(jìn)行測(cè)定。(一般的比色杯可以盛裝3ml溶液)。當(dāng)然,也可以用微量比色杯進(jìn)行測(cè)定。
4. 以 A280 為縱座標(biāo),Ve 為橫座標(biāo)畫出標(biāo)準(zhǔn)蛋白的洗脫曲線。
5. 以 Kav 為縱座標(biāo),logMw 為橫座標(biāo)作圖畫出一條標(biāo)準(zhǔn)曲線。
6. 以 Ve 為縱座標(biāo),logMw 為橫座標(biāo)作圖畫出一條標(biāo)準(zhǔn)曲線。
(五)未知蛋白分子量的測(cè)定
測(cè)定方法同標(biāo)準(zhǔn)曲線制作的1.、2.、3. 步相同,然后在標(biāo)準(zhǔn)曲線上查得logMw,其反對(duì)數(shù)便是待測(cè)蛋白質(zhì)的分子量。
注意: 實(shí)驗(yàn)完畢后,將凝膠全部回收處理,以備下次實(shí)驗(yàn)使用,嚴(yán)禁將凝膠丟棄或倒入水池中。