膠原酶在上皮類細胞原代培養時經常使用，作用對象是膠原組織，因此不容易對細胞產生損傷。消化原代培養的上皮類細胞用此酶效果更好。

　　胰蛋/白酶（簡稱胰/酶）是廣泛應用的消化劑.胰蛋/白酶是一種胰臟制品,對蛋白質有水介作用,主要作用于賴氨酸或精/氨酸相連接的肽鍵,使細胞間質中的蛋白質水介而使細胞分散開,在常用的蛋白酶中由于產品的活力和純度不同,對細胞的消化能力也不同,胰蛋/白酶對細胞的作用,取決于細胞類型、酶的活力、配制的濃度、消化的溫度、無機鹽離子、pH以及消化時間的長短等.

　　膠原酶是一種從細菌中提取出來的酶,對膠原有很強的消化作用.適于消化纖維性組織、上皮組織以及癌組織,它對細胞間質有較好的消化作用,對細胞本身影響不大,可使細胞與膠原成分脫離而不受傷害.該酶分離效果好,即使有鈣、鎂離子存在仍有活性,故可用PBS和含血清的培養液配制,即操作簡便又可提高細胞成活率,最終濃度200u/mL或0.0.3mg/mL.此酶消化作用緩和,無需機械振蕩,但膠原酶價格較高,大量使用將增加實驗成本.