關(guān)于PCR實(shí)驗(yàn)有哪些影響因素呢?我們一般想到的可能是獲取的DNA/RNA質(zhì)量、反轉(zhuǎn)錄的效率、引物的特異性乃至DNA聚合酶的保真度、擴(kuò)增長度等問題,但很少有人會想到耗材的選擇,可能也會影響您的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
我們一般想到的可能是獲取的DNA/RNA質(zhì)量、反轉(zhuǎn)錄的效率、引物的特異性乃至DNA聚合酶的保真度、擴(kuò)增長度等問題,但很少有人會想到耗材的選擇,可能也會影響您的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。那么關(guān)于PCR實(shí)驗(yàn)耗材我們改如何選擇呢?
首-先需要明確的是我們做的是哪種PCR實(shí)驗(yàn)。根據(jù)檢測方法的不同,PCR實(shí)驗(yàn)分為普通PCR法和熒光定量PCR法,前者一般是終點(diǎn)PCR跑膠法測定,所以在選擇耗材時(shí)需要關(guān)注的主要是耗材本身的導(dǎo)熱性和密封性;而后者是實(shí)時(shí)檢測熒光信號,除了導(dǎo)熱性和密封性外,對透光性和避光性也有所要求。換句話而言,可以做熒光定量PCR的耗材一定可以來做普通PCR,反之,效果卻會差很多!
確定好了實(shí)驗(yàn)類型,我們就可以選擇耗材了,如前面所述,我們知道了密封性、導(dǎo)熱性、透光性、避光性等因素是我們需要關(guān)注的,那為什么要關(guān)注這些呢?
一、密封性
密封性越好,產(chǎn)物的揮發(fā)越少,得到的產(chǎn)物就越多同時(shí)氣溶膠的產(chǎn)生也越少,對于下一輪實(shí)驗(yàn)的污染也就越少,也就意味著假陽性的產(chǎn)生率越低。
二、導(dǎo)熱性
導(dǎo)熱性越好越均一,PCR的速度就越快,準(zhǔn)確度也越高。
三、透光性
這主要是對于熒光定量而言,我們知道它是一種實(shí)時(shí)定量的方式,那么耗材本身的透光性就直接關(guān)系到我們檢測到的熒光信號多少,如果選擇耗材透光性不足,本該檢測到的信號檢測不到,那就會造成我們對結(jié)果的誤判。
四、避光性
這也是針對熒光定量而言的,同上面的因素,如果我們在整個(gè)實(shí)驗(yàn)過程中沒注意避光,帶有熒光的試劑過度被消耗,那直接就會影響我們實(shí)驗(yàn)的擴(kuò)增效率,導(dǎo)致不準(zhǔn)確的結(jié)果產(chǎn)生。