質粒抽提的基本原理及操作流程
⒈質粒抽提基本原理
在其中采用幾種水溶液及其硅酸化學纖維膜(超濾膜柱)。 水溶液Ⅰ:50 mM果糖 / 25 mMTris-HCl/ 10 mMEDTA,pH 8.0;水溶液Ⅱ:0.2 N NaOH / 1%SDS; 水溶液Ⅲ:3 M 醋酸鉀/ 2 M 醋酸/75%乙醇。
水溶液Ⅰ
果糖是使飄浮后的大腸埃希菌不容易迅速堆積到水管的底端;EDTA是Ca2+和Mg2+等二價金屬材料正離子的螯合劑,其關鍵目地是以便鰲合二價金屬材料正離子進而達到抑制DNase的特異性;可加上RNase A消化吸收RNA。
水溶液Ⅱ
此步為堿解決。在其中NaOH關鍵是以便融解體細胞,釋放出來DNA,由于在強偏堿的狀況下,細胞質產生了從兩層膜結構工程向微囊構造的轉變。SDS與NaOH聯用,其目地是以便提高NaOH的強偏堿,一起SDS做為陽離子表活劑毀壞脂兩層膜。那步要記牢二點:shou位,時間不可以太長,由于在那樣的偏堿標準下基因組DNA-p段也會漸漸地破裂;其次,務必溫柔混和,要不然基因組DNA會破裂。
水溶液Ⅲ
水溶液III的功效是沉定蛋白質和中和反應。在其中醋酸鉀是以便使鉀離子換置SDS中的鉀離子而產生了PDS,由于十二烷基硫酸鈉(sodium dodecylsulfate)碰到鉀離子后變?yōu)榱耸榛蛩徕?(potassium dodecylsulfate, PDS),而PDS不是溶水的,一起1個SDS分子結構均值融合2個碳水化合物,鉀鈉正離子換置所造成的很多沉定大自然就將絕大多數蛋白沉定了。2 M的醋酸是以便中合NaOH。基因組DNA如果產生破裂,要是是50-100 kb尺寸的片段,就沒有方法再被 PDS共沉淀了,因此堿解決的時間要短,并且不可猛烈震蕩,要不然蕞終獲得的質粒上都會有很多的基因組DNA滲入,瓊脂糖電泳能夠 觀查到這條濃濃總DNA條帶。75%乙醇關鍵是以便清理鹽分和抑止Dnase;一起水溶液III的強酸堿性都是以便使DNA盡快融合在硅酸化學纖維膜上
⒉質粒抽提流程
⑴應用質粒提取試劑盒獲取質粒時請參照實際試劑盒的操作指南。如Omega企業(yè)的E.Z.N.A.? Plasmid Mini Kit I, Q(capless) Spin (質粒提取盒)。
⑵堿裂解手提式法:此方式適用少量質粒DNA的獲取,獲取的質粒DNA可立即用以酶切、PCR測序、銀染編碼序列分析。方式給出:
①接1%含質粒的大腸埃希菌體細胞于2mlLB培養(yǎng)液。
②37℃震蕩塑造留宿。
③取1.5ml菌體于Ep管(離心管),以4000rpm抽濾3min,棄上清液。
④加0.lml水溶液I(1%果糖,50mM/LEDTApH8.0,25mM/LTris-HClpH8.0)充足混和。
⑤添加0.2ml水溶液II(0.2mM/LNaOH,1%SDS),輕輕地旋轉攪拌,放置冰浴5min.
⑥添加0.15m1預冷水溶液III(5mol/LKAc,pH4.8),輕輕地旋轉攪拌,放置冰浴5min.
⑦以10,000rpm抽濾20min,取上清液于另翻新Ep管。
⑧添加等容積的異戊醇,攪拌后靜放10min.
⑨以10,000rpm抽濾20min,棄上清。
⑩用70%酒精0.5ml清洗一回,吸干全部液體。
待沉定干躁后,溶解50ulTE緩沖液中(或60℃溫育雙蒸水)。