腸道微生物組是一個復(fù)雜的,相互關(guān)聯(lián)的物種生態(tài)系統(tǒng)。而且,像任何生態(tài)系統(tǒng)一樣,有些生物是捕食者,有些是獵物。由布里格姆婦女醫(yī)院和Wyss研究所的研究人員領(lǐng)導(dǎo)的一項新研究調(diào)查了噬菌體,即感染和殺死細菌的病毒的影響。
他們發(fā)現(xiàn)噬菌體可以對腸道微生物組的動態(tài)產(chǎn)生深遠的影響,不僅直接影響某些物種,而且還會對其他物種產(chǎn)生連鎖效應(yīng)。噬菌體也可能通過調(diào)節(jié)代謝物(包括大腦中發(fā)現(xiàn)的化學(xué)物質(zhì))來影響其人體宿主。該團隊包括作者Bryan Hsu博士和Wyss研究所的共同對應(yīng)資深作者Pamela Silver博士,以及馬薩諸塞州主機 - 微生物中心主任Brigham和博士Lynn Bry博士。細胞宿主和微生物。
“我實驗室的一個主要興趣是了解腸道微生物組動態(tài)的變化。噬菌體是微生物組的一個重要組成部分,但尚未進行過多次研究,”共同對應(yīng)的資深作者Georg Gerber醫(yī)學(xué)博士表示。博士,公共衛(wèi)生碩士,馬薩諸塞州主機 - 微生物中心的聯(lián)合主任,布里格姆病理學(xué)系計算病理學(xué)部主任。“有些人正在探索噬菌體治療,利用噬菌體殺死微生物,但噬菌體也在腸道中自然存在,與生態(tài)系統(tǒng)的其他部分共存。我們想知道他們在那里做了什么。”
為了解決這個問題,研究小組用一組確定的人類細菌物種定植了老鼠的腸道,然后添加了噬菌體,追蹤每種微生物的生長。利用高通量測序和計算分析,該團隊發(fā)現(xiàn)噬菌體引起了他們預(yù)期捕獲的物種的消耗,但對生態(tài)系統(tǒng)的其他部分(包括非目標物種的大量繁殖)產(chǎn)生了波動效應(yīng)。
除了研究對微生物的影響外,研究小組還研究了代謝組的影響 - 這些化學(xué)物質(zhì)可能來自宿主和存在的細菌。他們發(fā)現(xiàn),當他們用噬菌體調(diào)節(jié)微生物組時,他們可以看到代謝組的靶向變化,包括神經(jīng)遞質(zhì)水平和膽汁酸的變化。
“這一發(fā)現(xiàn)使我對后續(xù)工作著迷并提出了重要問題:我們可以使用噬菌體調(diào)節(jié)這些活動嗎?這可能是一種干預(yù)條件,例如抑郁癥,你想要改變神經(jīng)遞質(zhì)水平嗎?”格柏說。“即使它們不被用作直接治療藥物,我們的研究表明,噬菌體可能是了解改變微生物組的其他療法的潛在影響的良好工具。”
考慮到營養(yǎng)不良可能對代謝組和微生物組產(chǎn)生的深遠影響,格柏及其同事對研究發(fā)展中國家噬菌體和營養(yǎng)不良的交叉點特別感興趣。
“我們希望我們的工作將提供一個指導(dǎo)未來調(diào)查的框架,以闡明噬菌體,微生物群和宿主健康與疾病之間的相互作用,”格柏說。