你知道什么是微生物檢驗(yàn)嗎?你對(duì)微生物檢驗(yàn)了解嗎?下面是遠(yuǎn)慕生物為大家?guī)淼年P(guān)于微生物檢驗(yàn)必須要知道的三大耐藥機(jī)制的知識(shí),一起了解下吧。
一、產(chǎn)生滅活抗生素的各種酶
1、 β—內(nèi)酰胺酶(β-lactamase)
β—內(nèi)酰胺類抗生素都共同具有一個(gè)核心β—內(nèi)酰胺環(huán),其基本作用機(jī)制是與細(xì)菌的青霉su結(jié)合蛋白結(jié)合,從而抑制細(xì)菌細(xì)胞壁的合成。產(chǎn)生β—內(nèi)酰胺酶是細(xì)菌對(duì)β-內(nèi)酰胺類抗菌藥物產(chǎn)生耐藥的主要原因。細(xì)菌產(chǎn)生的β-內(nèi)酰胺酶,可借助其分子中的絲an酸活性位點(diǎn),與β—內(nèi)酰胺環(huán)結(jié)合并打開β—內(nèi)酰胺環(huán),導(dǎo)致藥物失活。迄今為止報(bào)道的β—內(nèi)酰胺酶已超過300種,1995年Bush等將其分為四型:第1型為不被克拉維酸抑制的tou孢菌su酶;第2型為能被克拉維酸抑制的β-內(nèi)酰胺酶;第3型為不被所有β—內(nèi)酰胺酶抑制劑抑制的金屬β-內(nèi)酰胺酶(需Zn2+活化)??杀灰?胺四乙酸和P-chloromercuribenzate所抑制;第4型為不被克拉維酸抑制的青霉su酶。臨床常見的β—內(nèi)酰胺酶有超廣譜β—內(nèi)酰胺酶、tou孢菌su酶(AmpC酶)和金屬酶。
(1)超廣譜β-內(nèi)酰胺酶(Extended-Spectrumβ-lactamases,ESBLs)
ESBLs是一類能夠水解青霉su類、tou孢菌su類及單環(huán)類抗生素的β—內(nèi)酰胺酶,屬Bush分型中的2型β—內(nèi)酰胺酶,其活性能被某些β—內(nèi)酰胺酶抑制劑(棒酸、舒巴坦、他唑ba坦)所抑制。ESBLs主要由普通β-內(nèi)酰胺酶基因(TEM—1,TEM—2和SHV—1等)突變而來,其耐藥性多由質(zhì)粒介導(dǎo)。自1983年在德國shou次發(fā)現(xiàn)ESBLs以來,目前已報(bào)道的TEM類ESBIs已有90多種,SHV類ESBLs多于25種。TEM型和SHV型ESBLs主要發(fā)現(xiàn)于肺炎克雷伯菌和大腸埃希菌,亦發(fā)現(xiàn)于變形桿菌屬、普羅威登斯菌屬和其他腸桿菌科細(xì)菌。
國內(nèi)近年來隨著三代tou孢菌su的廣泛使用,產(chǎn)ESBLs菌的檢出率逐年增加。NCCLs規(guī)定,凡臨床分離的大腸埃希氏菌和克雷伯氏菌均應(yīng)監(jiān)測(cè)是否為產(chǎn)ESBLs菌株;若產(chǎn)生,無論體外對(duì)第三代頭抱菌素、氨qu南的藥敏結(jié)果如何,均應(yīng)報(bào)告對(duì)三代tou孢菌su及氨qu南耐藥。另外,ESBLs菌株不僅對(duì)β-內(nèi)酰胺類抗生素有很高的耐藥率,而且對(duì)氨基糖苷類、喹喏酮類耐藥率也在60%左右,因此,臨床遇到由ESBLs引起的感染時(shí),建議shou選含β—內(nèi)酰胺酶抑制劑的復(fù)方抗生素制劑或亞an培南;對(duì)于tou孢吡肟等四代tou孢,尚有爭(zhēng)議,根據(jù)抗菌藥的PK/PD理論,適當(dāng)改變給藥劑量和給藥間隔。以使血藥濃度超過細(xì)菌MIC的時(shí)間達(dá)40%給藥間隔以上,或許是有效的。
(2)tou孢菌su酶(AmpC酶)屆Bush分類中的1型(Ⅰ型) β—內(nèi)酰胺酶。
通常將其分為由染色體介導(dǎo)產(chǎn)生的AmpC β—內(nèi)酰胺酶和由質(zhì)粒介導(dǎo)產(chǎn)生的AmpC β—內(nèi)酰胺酶,前者的產(chǎn)生菌有陰溝腸桿菌、銅綠假單胞菌等,后者主要由肺炎克雷伯氏菌和大腸埃希氏菌產(chǎn)生。AmpC酶可作用于大多數(shù)青霉su,第一、二、三代tou孢菌su和單環(huán)類抗生素。而第四代tou孢菌su、碳青霉烯類不受該酶作用。該酶不能被β—內(nèi)酰胺酶抑制劑所抑制。AmpCβ—內(nèi)酰胺酶的產(chǎn)生有2種可能:①在誘導(dǎo)劑存在時(shí)暫時(shí)高水平產(chǎn)生,當(dāng)誘導(dǎo)劑不存在時(shí),酶產(chǎn)量隨之下降,三代tou孢菌su、棒酸和碳青霉烯類抗生素是誘導(dǎo)型AmpC酶的強(qiáng)誘導(dǎo)劑;②染色體上控制酶表達(dá)的基因發(fā)生突變,導(dǎo)致AmpC酶持續(xù)穩(wěn)定高水平表達(dá)。由高產(chǎn)AmpC酶耐藥菌引起的感染死亡率很高。
實(shí)際上,所有的革蘭氏陰性菌都能產(chǎn)生染色體介導(dǎo)的AmpCtou孢菌su酶,在多數(shù)情況下為低水平表達(dá);在腸桿菌、檸檬酸桿菌、沙雷shi菌、銅綠假單胞菌中可高頻誘導(dǎo)產(chǎn)生,且常為高產(chǎn)突變株。當(dāng)臨床出現(xiàn)上述細(xì)菌感染,開始幾天三代tou孢菌su治療敏感,而隨后發(fā)生耐藥時(shí),我們可懷疑為高產(chǎn)AmpC酶的細(xì)菌感染,四代tou孢菌su和碳青霉烯類抗生素不受具影響,可供臨床選用。含酶抑制劑的復(fù)方制劑不能用于治療產(chǎn)AmpC酶菌株的感染。
(3)金屬酶(metalloβ-1actamase)
大部分β-內(nèi)酰胺酶的活性位點(diǎn)是絲an酸殘基,但也有一小部分活性位點(diǎn)為金屬離子的酶類。第一個(gè)發(fā)現(xiàn)的以金屬離子為活性中心的酶是由蠟樣芽抱桿菌產(chǎn)生的tou孢菌su酶,能被EDTA所抑制,之后世界各地均發(fā)現(xiàn)了能產(chǎn)生這類酶的各種細(xì)菌。1988年Bushshou次將該酶定名為金屬β-內(nèi)酰胺酶(metalloβ-1actamase),簡(jiǎn)稱金屬酶。金屬β-內(nèi)酰胺酶耐受β—內(nèi)酰胺酶抑制劑且可水解幾乎所有β—內(nèi)酰胺類抗生素(包括亞an培南)。該酶已在氣單胞菌、嗜麥芽窄食單胞菌、洋蔥伯克霍爾德氏菌中發(fā)現(xiàn),其中嗜麥芽窄食單胞菌的亞an培南耐藥性由染色體介導(dǎo),而脆弱擬桿菌、肺炎克雷伯氏菌、銅綠假單胞菌中質(zhì)粒介導(dǎo)的突變株在日本已有報(bào)道。由粘質(zhì)sha雷氏菌產(chǎn)生的金屬β—內(nèi)酰胺酶IMP-1型可在類似接合子的intl3上移動(dòng),已經(jīng)傳播到銅綠假單胞菌、肺炎克雷伯氏菌和產(chǎn)堿桿菌。金屬酶可以水解碳青霉烯類和最近開發(fā)的第四代tou孢菌su。金屬β-內(nèi)酰胺酶有廣泛傳播的潛力,對(duì)幾乎所有的β—內(nèi)酰胺類抗生素均具有水解活性,是目前所知的最qiang的β-內(nèi)酰胺酶-。
2、氨基糖甙修飾酶(或鈍化酶/滅活酶)
在細(xì)菌對(duì)氨基糖甙類抗生素產(chǎn)生耐藥的機(jī)制中,修飾酶介導(dǎo)的耐藥最wei流行,酶促修飾的氨基糖甙類抗生素不能與核糖體靶位作用,因此失去抗菌活性。修飾酶主要包括乙酰轉(zhuǎn)移酶、磷酸轉(zhuǎn)移酶和核苷轉(zhuǎn)移酶。三類氨基糖苷修飾酶的作用機(jī)制各不相同:乙酰轉(zhuǎn)移酶(AAC)修飾依賴于乙酰fu酶A的N-乙?;毫姿徂D(zhuǎn)移酶(APH)修飾依賴于ATP的O-磷酸化;核苷酸轉(zhuǎn)移酶(ANT)修飾依賴于ATP的腺苷化。在革蘭氏陰性病原菌中,最常見的氨基糖苷修飾酶是AAC(6’),使氨基糖苷類抗生素1—、3—、2’—或6'—位乙酰化,如今已發(fā)現(xiàn)16種編碼AAC(6’)的基因。銅綠假單胞菌和腸桿菌科細(xì)菌趨向于產(chǎn)生AAC(3)、AAC(6’)、ANT(2’’)以及APH(3’);葡萄球菌和糞腸球菌經(jīng)常產(chǎn)生ANT(4’)(4’’)或雙功能的AAC(6’)/APH(2")。葡萄球菌對(duì)慶大霉su、卡那霉su和妥布霉su的`耐藥性和腸球菌的高度慶大霉su耐藥性通常由雙功能酶介導(dǎo),這些酶通常(但非總是)由位于多重耐藥質(zhì)粒上的轉(zhuǎn)座子(Tn924)編碼,如葡萄球菌具有的轉(zhuǎn)座子Tn5405編碼的APH(3’)(提供卡那霉su、新霉su和阿米ka星耐藥性),而其他的定位于染色體。越來越多的菌株可產(chǎn)生2種或更多種酶,對(duì)抗氨基糖苷類抗生素。在過去幾年里常見的組合是慶大霉su修飾酶ANT(2’’)和AAC(3)]與AAC(6’)結(jié)合,導(dǎo)致對(duì)慶大霉su、妥布霉su、耐替米星、卡那霉su和阿米ka星的廣譜耐藥性。
氨基糖苷類抗生素對(duì)非發(fā)酵菌、腸桿菌科及一些革蘭氏陽性球菌均有很好的抗菌活性,與β—內(nèi)酰胺類抗生素聯(lián)用有協(xié)同抗菌作用,在感染治療中占有重要地位。但由于以上耐藥機(jī)制的存在,細(xì)菌耐藥問題也日趨嚴(yán)重,應(yīng)該引起重視,可喜的是阿米ka星等對(duì)MRSA和產(chǎn)ESBLs菌株仍保持17%-40%的敏感率。
二、改變藥物作用靶位
1、 青霉su結(jié)合蛋白(PBP)的改變導(dǎo)致的β—內(nèi)酰胺類抗生素耐藥
青霉su結(jié)合蛋白(PBP)參與了肽聚糖合成的最后階段。高分子量PBP常常為多模塊,具有N末端糖基轉(zhuǎn)移酶區(qū)和C末端轉(zhuǎn)肽酶區(qū)。轉(zhuǎn)肽酶區(qū)的活性位點(diǎn)絲an酸與酶的天然結(jié)構(gòu)相仿,可與與β—內(nèi)酰胺類抗生素發(fā)生不可逆酰化。青霉su結(jié)合蛋白(PBP)的改變常導(dǎo)致如下兩種臨床重要的耐藥表型。
(1)耐甲氧xi林金黃se葡萄球菌(Methicillin-resistant Staphylococcus arueus,MRSA)
MRSA是20世紀(jì)60年代英國首先報(bào)道的一種嚴(yán)重的臨床耐藥致病菌,20世紀(jì)80年代以來,世界各地都相繼發(fā)生MRSA醫(yī)院感染的暴發(fā)流行,并逐年增多。MRSA耐藥分為固有耐藥和獲得性耐藥,固有耐藥是由染色體介導(dǎo)的,其耐藥性的產(chǎn)生是因?yàn)榧?xì)菌產(chǎn)生一種特殊的青霉su結(jié)合蛋白PBP2a(或PBP2’),分子量為78000的蛋白質(zhì),與β內(nèi)酰胺類抗生素的親和力減低,從而導(dǎo)致細(xì)菌對(duì)β-內(nèi)酰胺類抗生素耐藥。PBP2a由mecA基因編碼,95%以上的MRSA菌株能檢測(cè)到mecA基因,而敏感株則無。獲得性耐藥是由質(zhì)粒介導(dǎo)的,細(xì)菌獲得耐藥基因后,產(chǎn)生大量β-內(nèi)酰胺酶(而不是PBPs),使耐酶青霉su緩慢失活,表現(xiàn)出耐藥性,多為臨界耐藥。
在MRSA檢測(cè)過程中,凡屬M(fèi)RSA,不管其對(duì)其他β-內(nèi)酰胺類抗生素MIC值或抑菌圈的大小,實(shí)驗(yàn)室均應(yīng)向臨床報(bào)告為對(duì)所有青霉su類、tou孢菌su類、碳青霉烯類、碳tou孢烯類和β內(nèi)酰胺類—酶抑制劑復(fù)合制劑耐藥,以免誤導(dǎo)臨床用藥。MRSA感染的治療是臨床十分棘手的難題之一,關(guān)鍵是其對(duì)許多抗生素具有多重耐藥性,萬古霉su是目前臨床上治療MRSA療效肯定的抗生素,應(yīng)用30多年來未發(fā)現(xiàn)耐藥菌株。
(2) 耐青霉su肺炎鏈球菌 (Penicillin resistant Streptococcus pneumoniae,PRSP)
長(zhǎng)期以來肺炎鏈球菌對(duì)青霉su高度敏感。MIC在0.005-0.01mg/L之間。1967年澳大利亞shou次報(bào)道耐青霉su肺炎鏈球菌,MIC為0.5mg/L,此后世界許多國家和地區(qū)均有報(bào)道,且耐藥率迅速上升。PRSP的耐藥機(jī)制肺炎鏈球菌的青霉su結(jié)合蛋白(PBP)發(fā)生改變,使其與青霉su的親和力減低。肺炎鏈球菌有6種PBP:1a、1b、2x、2a、2b和3,其中PBP2b最為重要,如果青霉su結(jié)合到PBP2b上并使之抑制即導(dǎo)致細(xì)菌溶解和死亡;反之,PBP2b發(fā)生突變,青霉su不能產(chǎn)生作用,則導(dǎo)致PRSP。在PRSP高耐菌株中(MIC≥2μg/m1)可有多達(dá)4種PBP(主要是1a、1b、2x、2b)同時(shí)發(fā)生改變[7]。
肺炎鏈球菌是引起社區(qū)獲得性肺炎的重要致病菌。目前,國內(nèi)PRSP的發(fā)生率在4%左右,明顯低于歐洲國家,在亞洲也屬于中等水平,且MIC多小于1mg/L,因此,在社區(qū)獲得性肺部感染病原菌中,PRSP尚不構(gòu)成嚴(yán)重威脅,青霉su仍可作為shou選治療藥物。但是耐藥沒有國界,中國日前PRSP發(fā)生率尚低.但決不意味著不要重視,而是應(yīng)該進(jìn)一步加強(qiáng)PRSP的耐藥監(jiān)測(cè)。對(duì)于PRSP感染臨床治療推薦使用tou孢噻肟/tou孢曲松、新喹諾酮類(如司pa沙星)。若屬PRSP嚴(yán)重感染則需應(yīng)用萬古霉su或加用li福平。
2、 DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶的改變引起喹諾酮類抗生素耐藥
喹諾酮類藥物的作用機(jī)制主要是通過抑制DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶而抑制DNA的合成,從而發(fā)揮抑菌和殺菌作用。細(xì)菌DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶有I、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ,喹諾酮類藥物的主要作用靶位是拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅱ和拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅳ。拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅱ又稱DNA促旋酶,參與DNA超螺旋的形成,拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅳ則參與細(xì)菌子代染色質(zhì)分配到子代細(xì)菌中。革蘭氏陰性菌中DNA促旋酶是喹諾酮類的第一靶位,而革蘭氏陽性菌中拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅳ是第一靶位。
當(dāng)編碼組成DNA促旋酶的A亞單位和B亞單位及組成拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅳ的parC和parE亞單位中任一亞基的基因發(fā)生突變均可引起喹諾酮類的耐藥性。在所有的突變型中,以gyrA的突變?yōu)橹?,?0%左右,其次是gyrB、parC和parE突變。在所有這些突變類型中,若Ⅱ型拓?fù)洚悩?gòu)酶上存在2個(gè)突變點(diǎn)(如gyrA和parC上),它們引起對(duì)氟kui諾酮類的耐藥遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于只有一個(gè)突變點(diǎn)(如gyrA或gyrB上),前者是后者的3-4倍。同時(shí)沒有發(fā)現(xiàn)突變僅出現(xiàn)在parC基因這一現(xiàn)象。這可能是因?yàn)镈NA促旋酶是氟kui諾酮類的重要靶位,gyrA亞單位的改變可引起酶結(jié)構(gòu)發(fā)生變化致空間位障,阻止喹諾酮類進(jìn)入喹諾酮類作用區(qū),或引起物理化學(xué)變化,干擾喹諾酮與酶的相互作用。這些結(jié)果顯示gyrA上突變的出現(xiàn)是引起細(xì)菌對(duì)喹諾酮類發(fā)生耐藥的主要機(jī)制,而parC突變只是進(jìn)一步引起銅綠假單胞菌對(duì)喹諾酮的高度耐藥。
DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶的改變是細(xì)菌耐喹諾酮類抗菌藥的主要機(jī)制,其他耐喹諾酮類的機(jī)制還包括后面將要談到的細(xì)菌膜通透性改變和主動(dòng)外排機(jī)制。
三、細(xì)胞膜透性屏障和抗生素主動(dòng)外排泵
細(xì)菌可以通過細(xì)胞壁的障礙或細(xì)胞膜通透性的改變,形成一道有效屏障,使得抗生素?zé)o法進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)并達(dá)到作用靶位而發(fā)揮抗菌效能,這也是細(xì)菌在進(jìn)化與繁殖過程中形成的一種防衛(wèi)機(jī)制。這類耐藥機(jī)制是非特異性的,主要見于革蘭氏陰性菌。因?yàn)楦锾m氏陰性菌細(xì)胞壁粘肽層外面存在著類脂雙層組成的外膜,外層為脂多糖,由緊密排列的碳氮分子組成,阻礙了疏水性抗菌藥進(jìn)入菌體內(nèi)。另外細(xì)菌外膜上還存在著多種孔蛋白,分子較大者為OmpF,分子較小者為OmpC,它們可形成特異性通道(OprD)和非特異性的通道(OprF),作為營養(yǎng)物質(zhì)和親水性抗菌藥物的通道。抗菌藥物分子越大,所帶負(fù)電荷越多,疏水性越強(qiáng),則不易通過細(xì)菌外膜。細(xì)菌發(fā)生突變失去某種特異孔蛋白后即可導(dǎo)致細(xì)菌耐藥性,另外由于外膜蛋白OprF的缺失,使藥物不易通過而產(chǎn)生耐藥性。如銅綠假單胞菌特異性孔蛋白OprD2缺失即導(dǎo)致碳青霉烯類抗生素耐藥。
另外一種導(dǎo)致細(xì)菌非特異性耐藥的機(jī)制是細(xì)菌主動(dòng)外排泵的存在,可以將進(jìn)入細(xì)菌體內(nèi)的藥物泵出膜外,從而逃避抗生素的作用。主動(dòng)外排系統(tǒng)由于能特異地將進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)的多種抗菌藥物主動(dòng)泵出細(xì)胞外,導(dǎo)致細(xì)胞獲得耐藥性。如大腸埃希氏菌中的多藥外排泵AcorAB-TolC系統(tǒng)可以導(dǎo)致細(xì)菌對(duì)包括四環(huán)素、氯霉su、紅霉su、β—內(nèi)酰胺類、li福平、氟kui諾酮類、氧化劑、有機(jī)溶劑、堿性染料等多種結(jié)構(gòu)不相關(guān)的藥物耐藥。銅綠假單胞菌的MexAB-OprM系統(tǒng)的主動(dòng)外排作用也是導(dǎo)致銅綠假單胞菌固有的多重耐藥性的重要因素之一。
細(xì)菌的膜耐藥機(jī)制主要表現(xiàn)在銅綠假單胞菌的多藥耐藥性。銅綠假單胞菌幾乎囊括了包括膜耐藥在內(nèi)的所有細(xì)菌耐藥機(jī)制,其耐藥已成為當(dāng)前感染治療中較為棘手的問題之一,尤其值得重視和研究。