游離的香豆素大多是低極性的，一般可用極性小的溶劑提取，回收溶劑，殘留物放冷或置冰箱，便會有結晶析出。有時殘留物太黏稠，晶體不易析出，可加少量溶劑，或濃縮至小體積時放到冰箱析晶。與糖結合成苷以后則有較高的極性，往往一種藥材中含有多種香豆素成分，一般可按極性遵遞增的方法用種溶劑抽提。目前常用的提取方法有如下方法：

1、溶劑法

根據香豆素存在種類和極性-情況，一般用石油醚、苯、乙-醚、乙酸乙酯、丙酮和甲醇依次萃取。由于苯的毒性較大，應盡量少用或不用。游離的香豆素一般極性低，用低極性溶劑提取濃縮后放置冰箱即可直接得到結晶或混合結晶。香豆素成苷后極性增加。利用此法對秦皮等植物進行提取分離

2、酸堿法

利用香豆素內酯遇堿開環成鹽、加酸后能恢復的特性進行分離。通常乙-醚萃取液先以碳酸氫鈉水溶液抽提去酸性成分；再以稀和冷的氫氧化鈉或氫氧化鉀的水溶液或醇溶液進行水解，香豆素因成鹽而溶于水，再用乙-醚提取不水解的中性成分。堿溶液用酸中和后，用乙-醚抽提出香豆素的內酯成分。而其他酯類皂化后所得的酸留在水液中。此法為規模化生產的經典方法，雖會產生一些副反應，但至今仍在使用。

3、超臨界流體提取法

超臨界流體提取新技術已被廣泛應用于香豆素類成分的提取中。極性小的游離香豆素可直接提取，而苷類則可通過加入乙醇等極性溶劑作夾帶來提取。利用超臨界流體進行蛇床子素的提取實驗，取得了較好的效果。