6 月 15 日,《自然—植物》在線發(fā)表了華中農(nóng)業(yè)大學(xué)教授 Kenichi Tsuda 團(tuán)隊(duì)的-新研究成果。研究人員利用植物體內(nèi)原位細(xì)菌轉(zhuǎn)錄組及蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),建立了病原細(xì)菌基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò),報(bào)道了被寄主免疫系統(tǒng)攻擊的病原細(xì)菌主要調(diào)控途徑。
細(xì)菌致病因子的表達(dá)和植物免疫成分的變化形成了植物與微生物相互作用過程中的復(fù)雜關(guān)系。該關(guān)系的研究對(duì)全面理解細(xì)菌如何引起植物病害以及植物如何保護(hù)自己免受病原菌侵染至關(guān)重要。
為了研究感染期間細(xì)菌基因的表達(dá)模式,研究人員選取了模式細(xì)菌丁香假單胞菌和擬南芥作為研究材料。
通過對(duì)丁香假單胞菌的信使核糖核酸(mRNA)及蛋白質(zhì)的分析,作者發(fā)現(xiàn)病原菌在宿主侵染過程中的核糖核酸(RNA)及蛋白表達(dá)與體外培養(yǎng)相比,存在較大差異,尤其是在植物與病原菌互作早期,說明這些早期基因表達(dá)模式的變化對(duì)侵染植物過程至關(guān)重要。
同時(shí),為了解植物免疫對(duì)細(xì)菌基因表達(dá)的影響,研究人員選取了與植物免疫過程相關(guān)的擬南芥突變植株。對(duì)細(xì)菌轉(zhuǎn)錄及蛋白在不同突變體植株中變化的分析表明,受水楊酸(SA)調(diào)控的植物免疫參與了對(duì)細(xì)菌致病相關(guān) mRNA 和蛋白質(zhì)的抑制過程。值得一提的是,SA 介導(dǎo)的植物免疫能夠特異地抑制介導(dǎo)病原菌毒性蛋白進(jìn)入宿主體內(nèi)的三型分泌系統(tǒng)組分蛋白的累積。
通過對(duì) 4765 個(gè)基因的表達(dá)進(jìn)行相互關(guān)聯(lián)及聚類分析,研究人員鑒定出許多功能未知的基因簇能夠參與細(xì)菌生長過程,同時(shí)成功預(yù)測出先前未知的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子,并進(jìn)一步驗(yàn)證了這些轉(zhuǎn)錄因子確實(shí)參與了相關(guān)基因的表達(dá)調(diào)控和與病原菌的致病性。
此研究為分析植物與病原細(xì)菌互作的過程中,細(xì)菌遺傳信息如何轉(zhuǎn)化為功能蛋白提供了證據(jù),有助于深入了解植物免疫抑制病原菌侵染的分子機(jī)制。